Sunday, June 26, 2011

Principle and challenges of genome-wide DNA methylation analysis

DNA methylation을 detecting 할 수 있는 실험적인 모든 것에 대해 대략적인 설명과 장단점을 나열한다. DNA methylation 실험 방법에 대해 전체적인 윤관을 잡고 싶다면 매우 유용한 논문. 설명이 필요 없다. 아래 표랑 그림만 봐도 정리가 잘 되어 있다. PCR 단계에서 methylation 정보를 잃기 때문에 기본적으로 PCR전의 treatment 하는데 이를 크게 3가지로 나눴고(enzyme digestion,affinity enrichment, bisulfite conversion) chip을 사용하느냐 sequencing을 하느냐에 따라 방법을 나눈다.

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