Widespread RNA and DNA Sequence Differences in the Human Transcriptome

science 지에 나온 논문. 예전에 RNA-seq 분석 리뷰 논문 볼때 RNA-editing에 대해 본적이 있었는데 이 논문이 그것에 대한 것을 연구한 논문(여기서는 RNA-editing에 의한 RNA-DNA Difference, RDD라고 표현). 흥미로운 점이 RNA-editing이라는 현상을 들었을때 아.. 그런 현상도 일어나는구나까지만 생각했는데.. 이 연구자들은 그것에 대해 연구를 해볼 생각을 했다는 것. 참.. 난 연구자에 대한 덕목이 부족하다..


abstract 내용은 다음과 같다. 27명의 B cell 에서의 RNA와 DNA 시퀀스 비교해서 10,000 개의 exonic site of RDD 를 찾음. 이와 같은 RDD는 여러 사람에서 공통적이였고 또 여러 tissue에 걸쳐서도 확인이 됐다고. 또 mass spectrometry를 찍어서 peptide sequence까지 확인했단다. 저널의 그림은 없고.. 표만 쭉 있는데.. 어떤 유전자의 어느 위치에서 RDD가 있다는 내용이 정리된 표들..


다음 그림은 wiki에 있는 RNA-editing에 관한 그림

아 이 논문을 보니 Mass spectrometry 데이터도 다뤄봤음 좋겠단 생각이 든다. 얼마전에 nature에 RNA와 protein의 life time과 양을 측정한 논문이 나왔는데.. 내 기억으로 꽤 차이가 났던 걸로 기억한다. 여튼 이런 논문들 보면 MS도 한번 다뤄보고 싶다는 생각이..